Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Stx12Q9ER00 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms