Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SgshQ9EQ08 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms