Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rpl4Q9D8E6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms