Protein–RNA interactions for Protein: Q9D842

Aplf, Aprataxin and PNK-like factor, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AplfQ9D842 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms