Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp2c55Q9D816 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp2c55Q9D816 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp2c55Q9D816 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp2c55Q9D816 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp2c55Q9D816 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp2c55Q9D816 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp2c55Q9D816 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp2c55Q9D816 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp2c55Q9D816 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp2c55Q9D816 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp2c55Q9D816 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp2c55Q9D816 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp2c55Q9D816 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp2c55Q9D816 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp2c55Q9D816 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp2c55Q9D816 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp2c55Q9D816 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp2c55Q9D816 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp2c55Q9D816 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp2c55Q9D816 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp2c55Q9D816 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp2c55Q9D816 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp2c55Q9D816 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp2c55Q9D816 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp2c55Q9D816 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyp2c55Q9D816 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyp2c55Q9D816 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyp2c55Q9D816 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyp2c55Q9D816 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyp2c55Q9D816 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp2c55Q9D816 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cyp2c55Q9D816 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cyp2c55Q9D816 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp2c55Q9D816 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp2c55Q9D816 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp2c55Q9D816 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp2c55Q9D816 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp2c55Q9D816 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp2c55Q9D816 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp2c55Q9D816 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp2c55Q9D816 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cyp2c55Q9D816 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cyp2c55Q9D816 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cyp2c55Q9D816 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cyp2c55Q9D816 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms