Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MsraQ9D6Y7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms