Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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