Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4933402E13RikQ9D4D2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms