Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrp2bpQ9D4C6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrp2bpQ9D4C6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrp2bpQ9D4C6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrp2bpQ9D4C6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrp2bpQ9D4C6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrp2bpQ9D4C6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrp2bpQ9D4C6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrp2bpQ9D4C6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrp2bpQ9D4C6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrp2bpQ9D4C6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrp2bpQ9D4C6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrp2bpQ9D4C6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrp2bpQ9D4C6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrp2bpQ9D4C6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrp2bpQ9D4C6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrp2bpQ9D4C6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrp2bpQ9D4C6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrp2bpQ9D4C6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrp2bpQ9D4C6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrp2bpQ9D4C6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrp2bpQ9D4C6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrp2bpQ9D4C6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrp2bpQ9D4C6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrp2bpQ9D4C6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrp2bpQ9D4C6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrp2bpQ9D4C6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms