Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nol3Q9D1X0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141 ms