Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M3

Cyc1, Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyc1Q9D0M3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cyc1Q9D0M3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyc1Q9D0M3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cyc1Q9D0M3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cyc1Q9D0M3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cyc1Q9D0M3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyc1Q9D0M3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyc1Q9D0M3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyc1Q9D0M3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyc1Q9D0M3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyc1Q9D0M3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyc1Q9D0M3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyc1Q9D0M3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyc1Q9D0M3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms