Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Utp11Q9CZJ1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Utp11Q9CZJ1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Utp11Q9CZJ1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms