Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL1

Tmem50a, Transmembrane protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem50aQ9CXL1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem50aQ9CXL1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem50aQ9CXL1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms