Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms