Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Atp6v0e1Q9CQD8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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