Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700029P11RikQ9CQ68 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms