Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Pcgf6Q99NA9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pcgf6Q99NA9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Pcgf6Q99NA9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Pcgf6Q99NA9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Pcgf6Q99NA9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Pcgf6Q99NA9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pcgf6Q99NA9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pcgf6Q99NA9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pcgf6Q99NA9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pcgf6Q99NA9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms