Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp4Q99ME9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms