Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cmtm3Q99LJ5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms