Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gps1Q99LD4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gps1Q99LD4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gps1Q99LD4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gps1Q99LD4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gps1Q99LD4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gps1Q99LD4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gps1Q99LD4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gps1Q99LD4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gps1Q99LD4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gps1Q99LD4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gps1Q99LD4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gps1Q99LD4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gps1Q99LD4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gps1Q99LD4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gps1Q99LD4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gps1Q99LD4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gps1Q99LD4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms