Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms