Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nlgn1Q99K10 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nlgn1Q99K10 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nlgn1Q99K10 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nlgn1Q99K10 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nlgn1Q99K10 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Nlgn1Q99K10 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nlgn1Q99K10 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nlgn1Q99K10 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nlgn1Q99K10 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nlgn1Q99K10 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nlgn1Q99K10 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nlgn1Q99K10 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nlgn1Q99K10 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nlgn1Q99K10 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nlgn1Q99K10 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nlgn1Q99K10 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nlgn1Q99K10 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nlgn1Q99K10 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nlgn1Q99K10 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nlgn1Q99K10 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nlgn1Q99K10 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nlgn1Q99K10 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nlgn1Q99K10 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Nlgn1Q99K10 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Nlgn1Q99K10 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nlgn1Q99K10 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nlgn1Q99K10 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nlgn1Q99K10 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Nlgn1Q99K10 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nlgn1Q99K10 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nlgn1Q99K10 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nlgn1Q99K10 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nlgn1Q99K10 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nlgn1Q99K10 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nlgn1Q99K10 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nlgn1Q99K10 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nlgn1Q99K10 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nlgn1Q99K10 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Nlgn1Q99K10 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nlgn1Q99K10 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nlgn1Q99K10 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nlgn1Q99K10 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nlgn1Q99K10 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nlgn1Q99K10 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nlgn1Q99K10 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nlgn1Q99K10 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nlgn1Q99K10 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nlgn1Q99K10 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nlgn1Q99K10 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nlgn1Q99K10 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nlgn1Q99K10 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms