Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Synpo2Q91YE8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms