Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx15Q91WE1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms