Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usb1Q91W78 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms