Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cabp4Q8VHC5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cabp4Q8VHC5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Cabp4Q8VHC5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cabp4Q8VHC5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cabp4Q8VHC5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cabp4Q8VHC5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cabp4Q8VHC5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cabp4Q8VHC5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cabp4Q8VHC5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cabp4Q8VHC5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cabp4Q8VHC5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cabp4Q8VHC5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cabp4Q8VHC5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cabp4Q8VHC5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cabp4Q8VHC5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cabp4Q8VHC5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cabp4Q8VHC5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Cabp4Q8VHC5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cabp4Q8VHC5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cabp4Q8VHC5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cabp4Q8VHC5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cabp4Q8VHC5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Cabp4Q8VHC5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Cabp4Q8VHC5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cabp4Q8VHC5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cabp4Q8VHC5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cabp4Q8VHC5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cabp4Q8VHC5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cabp4Q8VHC5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Cabp4Q8VHC5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cabp4Q8VHC5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cabp4Q8VHC5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cabp4Q8VHC5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cabp4Q8VHC5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cabp4Q8VHC5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Cabp4Q8VHC5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cabp4Q8VHC5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Cabp4Q8VHC5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Cabp4Q8VHC5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cabp4Q8VHC5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cabp4Q8VHC5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms