Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dkk4Q8VEJ3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dkk4Q8VEJ3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dkk4Q8VEJ3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dkk4Q8VEJ3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dkk4Q8VEJ3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dkk4Q8VEJ3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dkk4Q8VEJ3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dkk4Q8VEJ3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dkk4Q8VEJ3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dkk4Q8VEJ3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dkk4Q8VEJ3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dkk4Q8VEJ3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dkk4Q8VEJ3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms