Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC6

Ccm2l, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2lQ8VCC6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccm2lQ8VCC6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccm2lQ8VCC6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccm2lQ8VCC6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccm2lQ8VCC6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccm2lQ8VCC6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms