Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap2Q8VC34 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpap2Q8VC34 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.3 ms