Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ApobrQ8VBT6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ApobrQ8VBT6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms