Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sf3b4Q8QZY9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3b4Q8QZY9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms