Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3V1

Spata4, Spermatogenesis-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata4Q8K3V1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata4Q8K3V1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms