Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf13Q8K2W6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf13Q8K2W6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms