Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ91

Cd209b, CD209 antigen-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd209bQ8CJ91 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cd209bQ8CJ91 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd209bQ8CJ91 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd209bQ8CJ91 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd209bQ8CJ91 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms