Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CntrobQ8CB62 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CntrobQ8CB62 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CntrobQ8CB62 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CntrobQ8CB62 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CntrobQ8CB62 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CntrobQ8CB62 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CntrobQ8CB62 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CntrobQ8CB62 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CntrobQ8CB62 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CntrobQ8CB62 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CntrobQ8CB62 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CntrobQ8CB62 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CntrobQ8CB62 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CntrobQ8CB62 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CntrobQ8CB62 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CntrobQ8CB62 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CntrobQ8CB62 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CntrobQ8CB62 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CntrobQ8CB62 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CntrobQ8CB62 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CntrobQ8CB62 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CntrobQ8CB62 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CntrobQ8CB62 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CntrobQ8CB62 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CntrobQ8CB62 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CntrobQ8CB62 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CntrobQ8CB62 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CntrobQ8CB62 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CntrobQ8CB62 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CntrobQ8CB62 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CntrobQ8CB62 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CntrobQ8CB62 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CntrobQ8CB62 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CntrobQ8CB62 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CntrobQ8CB62 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CntrobQ8CB62 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CntrobQ8CB62 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CntrobQ8CB62 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CntrobQ8CB62 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CntrobQ8CB62 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1119.5 ms