Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Spef2Q8C9J3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Spef2Q8C9J3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms