Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms