Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apol7cQ8C6E1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apol7cQ8C6E1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apol7cQ8C6E1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apol7cQ8C6E1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apol7cQ8C6E1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apol7cQ8C6E1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apol7cQ8C6E1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apol7cQ8C6E1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Apol7cQ8C6E1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apol7cQ8C6E1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apol7cQ8C6E1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apol7cQ8C6E1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apol7cQ8C6E1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apol7cQ8C6E1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apol7cQ8C6E1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apol7cQ8C6E1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apol7cQ8C6E1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apol7cQ8C6E1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apol7cQ8C6E1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apol7cQ8C6E1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol7cQ8C6E1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms