Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Nop53Q8BK35 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nop53Q8BK35 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nop53Q8BK35 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nop53Q8BK35 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nop53Q8BK35 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nop53Q8BK35 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nop53Q8BK35 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nop53Q8BK35 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nop53Q8BK35 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nop53Q8BK35 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nop53Q8BK35 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop53Q8BK35 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop53Q8BK35 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop53Q8BK35 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop53Q8BK35 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop53Q8BK35 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop53Q8BK35 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop53Q8BK35 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop53Q8BK35 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop53Q8BK35 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nop53Q8BK35 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nop53Q8BK35 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nop53Q8BK35 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nop53Q8BK35 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms