Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJX2

6820408C15Rik, RIKEN cDNA 6820408C15, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6820408C15RikQ8BJX2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
6820408C15RikQ8BJX2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
6820408C15RikQ8BJX2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms