Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD4

Frmd3, FERM domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd3Q8BHD4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frmd3Q8BHD4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms