Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc50Q810U5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms