Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU5

Ccdc181, Coiled-coil domain-containing protein 181, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc181Q80ZU5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc181Q80ZU5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc181Q80ZU5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc181Q80ZU5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc181Q80ZU5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc181Q80ZU5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc181Q80ZU5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc181Q80ZU5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc181Q80ZU5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc181Q80ZU5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc181Q80ZU5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc181Q80ZU5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc181Q80ZU5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc181Q80ZU5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc181Q80ZU5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc181Q80ZU5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc181Q80ZU5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc181Q80ZU5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc181Q80ZU5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc181Q80ZU5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc181Q80ZU5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc181Q80ZU5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc181Q80ZU5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc181Q80ZU5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc181Q80ZU5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc181Q80ZU5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc181Q80ZU5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc181Q80ZU5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc181Q80ZU5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc181Q80ZU5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc181Q80ZU5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc181Q80ZU5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc181Q80ZU5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc181Q80ZU5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc181Q80ZU5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc181Q80ZU5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc181Q80ZU5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc181Q80ZU5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 400.1 ms