Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Npm2Q80W85 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Npm2Q80W85 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Npm2Q80W85 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms