Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms