Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms