Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrn2Q6PHP6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms