Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Trak1Q6PD31 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Trak1Q6PD31 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Trak1Q6PD31 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Trak1Q6PD31 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Trak1Q6PD31 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Trak1Q6PD31 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Trak1Q6PD31 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms