Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capn11Q6J756 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms