Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC6

Tro, Tro protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TroQ6DIC6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TroQ6DIC6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TroQ6DIC6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms